一代测序规范流程.doc

PCR 产物测序实验操作流程一、实验试剂和耗材准备(一)实验试剂实验试剂主要用途核酸提取试剂盒主要用于 DNA 或 RNA 的提取(详细步骤参考相应说明书) 上、下游引物 PCR 或测序反应 Extender PCR-to-Gel Master Mix ,2× PCR ddH 2O PCR 、测序反应及其它用途核酸荧光染料(4s Green) 琼脂糖凝胶电泳 DNA Marker 琼脂糖凝胶电泳 TBE 电泳缓冲液琼脂糖凝胶电泳琼脂糖琼脂糖凝胶电泳核酸外切酶 I (Exo I) PCR 产物的纯化碱性磷酸酶( AL P) PCR 产物的纯化经纯化后的 PCR 产物测序反应 BigDye 测序反应 100% 酒精测序产物纯化 125mM EDTA ( PH=8 )测序产物纯化 70% 酒精测序产物纯化 POP7 胶上机测序过程(毛细管电泳) Hi-Di 甲酰胺上机测序过程(毛细管电泳) 毛细管电泳 Buffer 上机测序过程(毛细管电泳) Sequence Standard (3500 )测序标准品(阳性对照) (二) 、实验耗材实验耗材主要用途 EP 管各种试剂的分装、盛放、储存等 管支架 或 2mlEP 管的支撑或存放 管P CR 八连管及八连管盖 PCR 96孔板 PCR 、测序反应及上机测序各种规格微量移液器微量试剂的定量和移取各种规格移液器吸头配合移液器的使用(吸附试剂) 96孔板支架固定和支撑 96孔板、八连管以及 PCR 单管 96孔板封垫封板用封板滚轮封板用冰维持待反应试剂低温环境各种规格量筒溶液的稀释或试剂的配置锥形瓶琼脂糖凝胶的熔化容量瓶溶液的稀释与试剂的配置药匙和称量纸试剂的称量凝胶槽和凝胶梳琼脂糖凝胶的凝固和加样孔的形成计时器计时记号笔做各种记号或标记一次性手套防污染和保护作用铝箔封96孔板二、实验仪器实验仪器主要用途制冰机制冰电冰箱试剂的储存高速台式离心机试剂的离心 M ini式离心机瞬离试剂旋涡式混合振荡器混匀试剂电子分析天平试剂的称量核酸检测仪核酸纯度和浓度的检测 PCR 仪 PCR 电泳仪和水平电泳槽琼脂糖凝胶电泳凝胶成像仪核酸琼脂糖凝胶电泳的检测和分析基因分析仪 DNA 的测序或片段分析蒸汽式高压湿热消毒器试剂、实验耗材及用具的消毒电热鼓风干燥箱实验用品的干燥恒温水浴锅提供恒温环境三、实验操作具体步骤(一)核酸的提取按照 DNA 或 RNA 提取试剂盒操作(具体操作步骤参考试剂盒操作说明书), 如是 RNA 需进一步反转录为 cDNA 。-20 ℃保存备用。(二)测序 PCR 模板的制备( 1) 、预先制备适量冰( 2) 、在冰上融化模板 DNA 、引物以及 Extender PCR-to-Gel Master Mix ( 3) 、按照以下反应体系进行 PCR 并保持反应体系在冰上成分体积( 20μl体系) 终浓度 Extender PCR-to-Gel Master Mix ,2× 10μl1× 10μM上游引物 -2 μl -1 μM 10μM下游引物 -2 μl -1 μM 50ng / μl的模板 -1 μl 5-50ng ddH 2O根据需要—( 4 )将反应体系放入 PCR 仪,执行以下反应程序 95℃ 5