江浙蝮蛇毒IX因子结合蛋白（AHP IXbp）和尖吻蝮蛇毒锌金属蛋白酶AaH IV自降解产物DCmotifacucetin的结构和功能关系探究.pdf

中国科学技术大学
博士学位论文
江浙蝮蛇毒IX因子结合蛋白(AHP IX-bp)和尖吻蝮蛇毒锌金属
蛋白酶AaH IV自降解产物D/C-motif(acucetin)的结构和功能关
系研究
姓名:臧建业
申请学位级别:博士
专业:生物化学与分子生物学
指导教师:牛立文;滕脉坤
20030701
摘要—和其它蛇毒来源的/蜃咏岷系鞍椎反应体系的降低到弱酸性范围,、生化性质鉴定、序列测定、。。.,不能结合蜃樱虼薃得到的新的因子结合蛋白。比较氨基酸序列显示,/蜃咏岷系鞍仔蛄兄饕5牟畋鹪贏,这一区域的氨基酸残基的差别可能与/蜃咏岷系白允侗鹋涮宓牟钜煨韵喙亍合具有锌离子和依赖性,在中性或弱碱性条件下,比弱酸性条件下强得多。,。用分子置换法解决了相位问题,。在和两种结晶条件下,的整体结构很相似,均方差仅为条件的晶体结构中,双重构象,这种结构的变化可能与钚缘膒览敌韵喙兀瓵不同条件下结构的差异揭示了/蜃咏岷系鞍子肱涮褰岷蟨览敌缘慕峁够。⒓馕球笊叨境鲅6舅豂到獠颽拇炕⒉糠中蛄胁舛ā⑿灾始ê⒅性或弱碱性条件下,能很快地发生自降解反应,生成一个稳定的降解产物,命名为,其分子量约为酶结构域,与从蛇毒中分离得到的含有类去整合素结构域和富含半胱氨酸结构域的蛋白序列同源性很高,也含有类去整合素结构域和富含半胱氨酸结构域。研究发现将能分离得到分子量约为到庵屑洳铩芤种艫和胶原诱导的血小板聚集。在硫酸铵体系中获得了的晶体,空间群为飓О问猘..ノ./,一个独立区仅有~个分子。获得晶体的衍射数据为结构的解析奠定了基础.Ⅱ笊叨綢蜃咏岷系鞍二硫键连接的异源二聚体,,,别在且博’论文.
甆—Ⅲ甇瓸,甈琾,。珹·,.——.甋/甅猟—甌瑂..;甌..甈.·,獀瓵;.。重博郝畚摘要
‰..琹—甌—狪甀—.琣:博郝畚摘猯..要
致谢本论文是在牛立文教授和滕脉坤教授的悉心指导下完成的,牛立文教授严谨的治学态度、渊博的知识,滕脉坤教授开放的科研作风、丰富的科研经验深深地教育了我。两位导师教给了我科学的思维方法、科研的基本思路和结构生物学领域的基本知识和研究技能。感谢两位导师在五年中对我的谆谆教诲,领着我一步步从门外跨进科学的圣殿。感谢龚为民教授对我的关心和帮助,感谢他在一些科学问题上给我的建议和指导,帮助我熟悉和使用生物大分子晶体学软件,他丰富研究经验、开创性的思维方式使我获感谢朱中良老师,在我刚进实验室时给我的无私帮助,帮助我熟悉实验室的环境,手把手的教会了我基本的实验技术,并在我实验中遇到问题时给了很多有益的建议。感谢朱志强和俞扬同学参与了本论文的研究,帮助完成了本论文中的很多实验。没有他们的帮助,本论文就不能顺利地按时完成。因克隆过程中给予的技术上的指导和帮助。感谢赵伟同学在软件安装使用过程中的帮助。感谢喻志强老师在蛋白氨基酸序列测定的过程中给予的帮助,感谢张天翼同学在设计引物时给予的帮助,感谢李平博士在完成笛槭备璧闹傅己桶镏感谢汪德强、郭敏、朱志强和莫茜同学在我最无奈、无助和郁闷的时候给我的劝解、鼓励和支持,帮助我顺利地完成我的毕业论文。感谢本实验室的其它老师和同学在工作和生活中给我的热情帮助,他们是:张晓、朱学勇博士、龚萍、何海辉、黄庆秋博士、梁治、王静、楼晓华、周东文、荣辉、童水龙、徐萌、杨伟丽、李小武、徐谷峰、孙金鹏、涂雄鹰、刘群、于晓、查文娟、陈腊梅、洪艳艳、何爽、郑丹丹、黄铧、杨秋月、郑定海、孙明璇、赵剑飞、周晖皓、王翠萍、王瑞莲等。他们给了我一个特别的工作环境,给了我完普自己,改变自己处世方式的机会。同时也感谢生命科学学院所有关心和帮助过我的老师和同学。特别感谢养育我的父母,感谢他们这么多年对我的教导、关心、爱护、鼓励和支持。没有他们多年艰辛的付出,就不会有我的今天。也感谢我的妻子和她的家人,感谢他们对我的理解和支持。感谢刘四九博士在文献查阅的过程中给予的帮助。感谢范军老师和张宏民同学在基谨以此文献给我深爱的父母和家人益非浅。‘
第一篇综述—蛇毒蛋白对凝血系统的作用第一章凝血系统及止血过程第一节凝血系统和聚集等活性密切相关。血小板表面膜上有许多糖蛋白,这些糖蛋白对血小板的生理和完成